Родился в с. Коченёво (ныне – пгт Коченёво Новосибирской обл.). Получил среднее образование. В Красной армии с 1939 г. В 1940 г. окончил Челябинское военное авиационное училище лётчиков-наблюдателей. С начала Великой Отечественной войны на фронте. Однажды, ещё в первые месяцы войны, его бомбардировщик совершил вынужденную посадку на оккупированной немцами территории в Подмосковье. К самолёту кинулись автоматчики, но Николай вместе с воздушным стрелком успел снять пулемет и отбил атаку. На другой день экипаж встретил наших солдат, попавших в окружение. Так появился партизанский отряд из 23 человек, полтора месяца сражавшийся с противником. Они нападали на немецкие гарнизоны, перерезали дороги, обрывали проводную связь. 14 ноября 1941 г. Аргунов возвратился в полк, имея на руках документы, подтверждающие его активное участие в партизанской борьбе. Николай Филиппович вернулся в лётный состав. Во время выполнения одного из заданий вышел из строя правый мотор. Лётчик продолжил бой и лишь когда кончились боеприпасы, сумел удачно приземлиться на своей территории. Старший лейтенант Николай Аргунов к октябрю 1944 г. совершил 172 боевых вылета на разведку и бомбардировку военных объектов, живой силы и техники противника. Член ВКП(б) с 1941 г. Погиб при освобождении Прибалтики 22 октября 1944 г. при уничтожении цели в районе Мемель (ныне – г. Клайпеда, Литва): его самолёт был сбит зенитным огнём. Похоронен в литовском г. Ретавас. Указом ПВС СССР от 23 февраля 1945 г. за образцовое выполнение заданий командования и проявленные мужество и героизм в боях с немецко-фашистскими захватчиками старшему лейтенанту Н. Ф. Аргунову присвоено звание Героя Советского Союза (посмертно).